xcode(4.3.2)でのプロジェクト名とスキーム名の変更方法を記載しておきます。

1.Project Navigatorでトップ階層(プロジェクト名が書いてある)を選択状態にする。
※Project Navigatorは画面左側にあるエリア

2.File InspectorのProject Nameを任意の名称に変更する。
※File Inspectorは画面右側にあるエリア
(ウィンドウが出てきて変更の確認画面が出る。)

3.左上のRun Stopボタンの横にある、[スキーム名＞IPhone 5.1 Simulator]のスキーム名をクリックしてManage Scheme…を選択します。

4.現在のスキーム名が表示されている部分をゆっくりクリックして任意の名前に変更してokボタンをクリックします。